А не проще мастикой покрыть? Обработать стыки со стеклохолстом и промазать все битумной мастикой в два слоя.
Если у Вас скатная кровля, то мастика туда не подойдет. Поскольку мастичные кровли только для плоских кровель. Изначально скорее всего вы взяли обычный рубероид для наплавления и закрепили механически, а это ошибка и довольно таки серьезная. В вашем случае можно использовать Гибкую черепицу (битумную) и как подложку использовать подкладочные ковры, а не рубероид (еврорубероид).
Тоже поглядываю в сторону гибкой черепицы. Что вы скажете по поводу SHINGLAS? Я читал, что у такой черепицы при качественной укладке хорошие гидроизоляционные свойства.
