Можна ли применять пенопласт с гидроизоляционной пленкой

да думаю можно просто на перекрытие, а слой стяжки можно сделать 2 см...

 

Плотность прилегания пенопласта больше зависит не от наличия клея, а от ровности поверхности, если у вас основание более-менее ровное можно без клея, если не очень ровное, то желательно выровнять
Насколько я понял Пітон предлагал пенопласт приклеить только для того чтобы его не украли, если вы все равно планируете сверху стяжку, то приклеивать совсем не обязательно.
Стяжка такой толщины рекомендуется для качественного распределения нагрузки, если у вас там шастают посторонние то под их ногами стяжка в 1 см может и поламаться и повдавливаться в пенопласт, если уж будете наносить таким тонким слоем, то может хоть проармировать фиброй стоит

 

Я не пойму зачем вам такую большую площадь утеплять. Делайте над своей квартирой, стяжку устраивайте 2 см с армирующей сеткой, а течь вы пленкой не уменьшите, нужно ремонтировать кровлю.